Sul territorio della Comunità Montana della Montagna Fiorentina sono presenti numerosi allevamenti di razze selezionate delle specie bovina, equina ed ovina più diffuse nella Provincia di Firenze.Gli allevatori di bovini ed ovini si sono specializzati nella produzione del latte e della carne, curando un'alimentazione naturale ed ricercando ottimali condizioni di benessere per gli animali. Sono state scelte le razze più idonee a ciascun ambiente, conservandone alcune autoctone o introducendone di nuove tra le più rilevanti a livello europeo. Per il cavallo, venuta meno l'utilità dell'animale come forza lavoro e riscoperta la funzione ricreativa, si allevano più razze per le varie esigenze.

La Comunità Montana Montagna Fiorentina in qualità di Ente delegato dalla Regione Toscana gestisce l'istruttoria per i contributi previsti dalla L.R. 1/98 per il miglioramento genetico del patrimonio zootecnico attraverso l'acquisto di riproduttori (maschi e femmine) iscritti nei libri genealogici o nei registri anagrafici.

Per i propri allevatori la Comunità Montana ha avviato anche il progetto Natura Amica che prevede l'erogazione di contributi ad incentivo e sostegno dell'innovazione nella zootecnia locale.